Naruto tente de se libérer de l’étreinte de Nagato sans succès ; Killer Bee vient à son secours mais se fait coincer par les bras mécaniques de Shuradô que Nagato fait sortir de lui. Alors que la situation est critique pour eux deux, Itachi vient les sauver en les prenant sous la protection de son « Susanô » et en envoyant des kunai dans les yeux des invocations de Nagato pour limiter le champ de vision du Rinnegan. Pour essayer de les emprisonner tous les trois, Kabuto fait utiliser à Nagato la « Naissance de l'astre divin ». Itachi analyse l’attaque et demande à ses compagnons de lancer vers le noyau d’attraction leur plus puissante technique. Une fois celui-ci détruit par l’« Orbe Shuriken » de Naruto, la « Bombe bijû » de Bee et le « Le magatama de Yasaka » d’Itachi, ce dernier scelle Nagato avec l’épée de Totsuka. Avant de disparaître, Nagato demande à Naruto de rattraper son échec et la mauvaise voie qu’il a pris. Naruto est furieux contre l’utilisation de la « Réincarnation des âmes » forçant à se battre contre des personnes chères ; Itachi déclare qu’il va s’occuper de Kabuto. Naruto lui demande de le laisser s’occuper de tout et tente de créer un clone, mais se trouve à court de chakra. Itachi le sermonne en lui rappelant qu’il est arrivé à ce niveau de puissance grâce à ses amis, et que s’il persiste à vouloir tout gérer lui-même, il deviendra arrogant et prendra le même chemin que Madara Uchiwa. Naruto se souvient des paroles d’Iruka et se range au conseil d’Itachi. Ce dernier brûle le corbeau portant l’œil de Shisui Uchiwa ne pouvant plus resservir avant dix ans, et dit à Naruto qu’il porte en héritage la volonté de Shisui de protéger le village. Alors que Naruto lui dit qu’il pourrait convaincre lui-même Sasuke maintenant, Itachi décline en disant qu’il a échoué en voulant tout gérer lui-même, et qu’il fait maintenant confiance à Naruto pour s’occuper de Sasuke.